Στις 25 Οκτωβρίου 2011 ο βουλευτής του ΣΥΡΙΖΑ Δ. Παπαδημούλης, με αφορμή δημοσίευμα για την επιζήμια για το δημόσιο ταμείο εμπορική εκμετάλλευση υπόγειου πάρκινγκ της Μονής Φιλοθέου στο κέντρο της Θεσσαλονίκης, υπέβαλε ερώτηση στο Υπουργείο Οικονομικών.
Ο βουλευτής του ΣΥΡΙΖΑ, επικαλούμενος το δημοσίευμα, σύμφωνα με τo οποίo η αγορά του σταθμού έγινε από τη Μονή με δάνειο υπερδεκαπλάσιο της αντικειμενικής αξίας του ακινήτου και στη συνέχεια η εκμετάλλευσή του έγινε από εταιρεία η οποία, προκειμένου να απαλλαγεί από την καταβολή φόρου, συμφώνησε με όρο του συμβολαίου να καταβάλει στη Μονή το 90% των ακαθάριστων εσόδων, ρώτησε αν έγινε έλεγχος νομιμότητας στη σύναψη του δανείου, στο μισθωτήριο συμβόλαιο, καθώς και τι φόρο εισοδήματος έχει καταβάλλει η Μονή Φιλοθέου για το 2010. Επίσης ρώτησε, ποια εισοδήματα δηλώσαν οι μονές του Αγίου όρους για το 2010 καθώς και πόσοι είναι οι βεβαιωθέντες φόροι σε Μονές και ναούς και πόσοι οι εισπραχθέντες για το 2010.
Σύμφωνα με το ίδιο δημοσίευμα, από το αφορολόγητο καθεστώς της μονής επωφελούνταν διάφορες εταιρείες αποκομίζοντας σημαντικά κέρδη, στερώντας από το δημόσιο τεράστια έσοδα, καθότι οι Μονές εξαιρούνται από την απόδοση ΦΠΑ και παρακάμπτουν την απόδοση του φόρου μεταβίβασης ακινήτων.
Σύμφωνα με πρόσφατη έγγραφη απάντησή του Υπουργού Οικονομικών Ευάγγελου Βενιζέλου: «[..] η Ιερά Μονή Φιλοθέου έχει δηλώσει για το οικονομικό έτος 2011 καθαρό φορολογητέο εισόδημα ύψους 1.794.748,07 ευρώ και ο αναλογών φόρος ανέρχεται σε 358.949,62 ευρώ».
Ο Υπουργός Οικονομικών σημειώνει, επίσης, ότι: «Η αρμόδια διεύθυνση του υπουργείου Οικονομικών ανέθεσε σε οικονομικό επιθεωρητή τη διενέργεια έρευνας εφαρμογής ή μη των φορολογικών διατάξεων από υπαλλήλους που υπηρετούν στις ΔΟΥ που εμπλέκονται στην οικεία υπόθεση».
Σύμφωνα με την απάντησή του Υπουργού Οικονομικών: «από την πορισματική έκθεση που υπέβαλε ο αρμόδιος οικονομικός επιθεωρητής προέκυψε ανάγκη περαιτέρω διερεύνησης τόσο ως προς τις ευθύνες των υπαλλήλων, όσο και ως προς την ολοκλήρωση των φορολογικών ελέγχων και αναμένονται πλέον οι αντίστοιχες πορισματικές εκθέσεις».
Πάρα ταύτα, χρήζει αναφοράς το γεγονός ότι δεν απαντήθηκε από τον Υπουργό Οικονομικών το σύνολο των ερωτημάτων που συμπεριλαμβάνονταν στην αρχική ερώτηση του Δ.Παπαδημούλη.
Με αφορμή αυτή την επιζήμια για το δημόσιο ταμείο υπόθεση της Ιεράς Μονής Φιλοθέου από την οποία προκύπτουν ευθύνες, όπως υποστηρίζει στην απάντησή και ο Υπουργός Οικονομικών, αλλά και το σκάνδαλο της Μονής Βατοπεδίου, ο βουλευτής του ΣΥΡΙΖΑ Δ. Παπαδημούλης υπογραμμίζει την επείγουσα ανάγκη συνολικού ελέγχου των οικονομικών στοιχείων και των καθαρά εμπορικών δραστηριοτήτων των Μονών και των εκκλησιών.